Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkx1-2P42580 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx1-2P42580 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms