Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tac1P41539 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms