Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbP41155 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LtbP41155 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LtbP41155 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LtbP41155 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LtbP41155 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LtbP41155 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LtbP41155 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LtbP41155 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms