Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VhlP40338 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VhlP40338 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VhlP40338 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VhlP40338 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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