Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd1P40201 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Chd1P40201 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chd1P40201 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Chd1P40201 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chd1P40201 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chd1P40201 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms