Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf2P39429 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf2P39429 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms