Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col18a1P39061 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col18a1P39061 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms