Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lig1P37913 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig1P37913 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms