Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprkP35822 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtprkP35822 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtprkP35822 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprkP35822 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprkP35822 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms