Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin1P35438 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin1P35438 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms