Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab23P35288 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab23P35288 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms