Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3dP35276 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3dP35276 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3dP35276 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms