Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola1P33609 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola1P33609 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pola1P33609 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pola1P33609 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pola1P33609 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pola1P33609 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms