Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nedd1P33215 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms