Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc10P31257 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms