Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tacr1P30548 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tacr1P30548 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms