Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Casp2P29594 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casp2P29594 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms