Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms