Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BgnP28653 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BgnP28653 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BgnP28653 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BgnP28653 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BgnP28653 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BgnP28653 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BgnP28653 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms