Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Etv4P28322 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Etv4P28322 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms