Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-DMaP28078 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms