Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl3P27659 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl3P27659 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms