Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Xrcc5P27641 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc5P27641 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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