Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
U2af2P26369 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
U2af2P26369 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
U2af2P26369 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms