Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CftrP26361 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CftrP26361 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CftrP26361 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CftrP26361 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CftrP26361 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CftrP26361 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CftrP26361 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CftrP26361 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CftrP26361 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CftrP26361 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CftrP26361 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CftrP26361 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CftrP26361 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CftrP26361 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CftrP26361 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CftrP26361 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CftrP26361 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CftrP26361 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CftrP26361 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CftrP26361 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CftrP26361 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CftrP26361 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CftrP26361 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms