Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccnd1P25322 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccnd1P25322 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms