Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd11P23813 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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