Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ggta1P23336 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ggta1P23336 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ggta1P23336 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms