Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp36P22893 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms