Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms