Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcb1aP21447 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms