Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim1P20664 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prim1P20664 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prim1P20664 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim1P20664 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms