Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrkcaP20444 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrkcaP20444 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms