Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou5f1P20263 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms