Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VimP20152 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VimP20152 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VimP20152 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VimP20152 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VimP20152 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VimP20152 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VimP20152 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VimP20152 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VimP20152 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms