Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifrd1P19182 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifrd1P19182 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms