Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnc1P19123 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tnnc1P19123 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms