Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RargP18911 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RargP18911 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RargP18911 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RargP18911 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RargP18911 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RargP18911 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RargP18911 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RargP18911 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RargP18911 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RargP18911 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms