Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rps6ka1P18653 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rps6ka1P18653 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms