Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb1P17919 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb1P17919 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms