Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptan1P16546 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptan1P16546 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms