Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Calb1P12658 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms