Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PolP11369 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PolP11369 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PolP11369 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PolP11369 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PolP11369 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PolP11369 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms