Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd4P10628 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms