Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PolP10400 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PolP10400 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PolP10400 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PolP10400 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PolP10400 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PolP10400 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PolP10400 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP10400 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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