Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxb4P10284 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb4P10284 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms