Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Schip1P0DPB4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms