Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatspereP0DP43 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatspereP0DP43 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms