Protein–RNA interactions for Protein: P03966

Mycn, N-myc proto-oncogene protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycnP03966 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MycnP03966 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MycnP03966 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MycnP03966 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MycnP03966 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MycnP03966 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MycnP03966 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MycnP03966 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MycnP03966 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MycnP03966 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MycnP03966 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms