Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-AaP01910 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-AaP01910 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms